25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4190 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  950    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  44.59 
 
 		 488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  44.36 
 
 		 465 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  40.52 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  25.05 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  28.53 
 
 		 535 aa  90.5  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 586 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  26.92 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  27.86 
 
 		 435 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  26.58 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  29.64 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  26.59 
 
 		 544 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  26.03 
 
 		 499 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  26.59 
 
 		 544 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  26.59 
 
 		 544 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  28.78 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  26.6 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  26.44 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  25.61 
 
 		 530 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  26.28 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  24.42 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  25.45 
 
 		 475 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  24.15 
 
 		 461 aa  54.3  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  27.54 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  29.68 
 
 		 510 aa  43.5  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>