38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4675 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  100 
 
 		 496 aa  978    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  42.14 
 
 		 523 aa  309  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  38.56 
 
 		 485 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  40.58 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  40.3 
 
 		 475 aa  250  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  35.77 
 
 		 485 aa  245  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  41.77 
 
 		 498 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  37.42 
 
 		 544 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  37.42 
 
 		 544 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  37.42 
 
 		 544 aa  236  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  36.4 
 
 		 486 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  39.13 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  36.66 
 
 		 560 aa  224  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  36.14 
 
 		 535 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  36.16 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  39.71 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  37.44 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  36.61 
 
 		 530 aa  206  9e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  36.7 
 
 		 447 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  37.61 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  36.05 
 
 		 461 aa  195  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  37.4 
 
 		 561 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  37.06 
 
 		 552 aa  193  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  38.88 
 
 		 564 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  34.63 
 
 		 470 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  36.75 
 
 		 456 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 629 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  35.82 
 
 		 648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  29.68 
 
 		 465 aa  90.5  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  26.84 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  27.44 
 
 		 488 aa  66.6  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  26.86 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  36.28 
 
 		 401 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0984  hypothetical protein  38.3 
 
 		 491 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  33.33 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  39.82 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  31.38 
 
 		 396 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3564  hypothetical protein  27.83 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.53184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>