38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  100 
 
 		 535 aa  1068    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  64.77 
 
 		 519 aa  605  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  55.06 
 
 		 544 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  55.06 
 
 		 544 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  55.06 
 
 		 544 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  52.01 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  54.91 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  55.51 
 
 		 561 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  51.42 
 
 		 552 aa  432  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  48.59 
 
 		 586 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  48.55 
 
 		 564 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  47.75 
 
 		 498 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  41.62 
 
 		 499 aa  286  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  38.83 
 
 		 485 aa  273  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  38.39 
 
 		 523 aa  264  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  37.37 
 
 		 485 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  39.51 
 
 		 475 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  36.14 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  39.92 
 
 		 490 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  37.43 
 
 		 486 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  37.72 
 
 		 447 aa  226  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  34.89 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  34.53 
 
 		 435 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  38.07 
 
 		 456 aa  188  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  32.58 
 
 		 470 aa  161  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  33.72 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 648 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  36.04 
 
 		 629 aa  137  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  29.1 
 
 		 488 aa  113  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  31.45 
 
 		 465 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  28.81 
 
 		 481 aa  108  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  28.5 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  27.05 
 
 		 393 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  27.51 
 
 		 401 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  26.75 
 
 		 396 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  26.75 
 
 		 396 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  36.78 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.339375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  30.29 
 
 		 705 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>