32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7314 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  65.89 
 
 		 629 aa  729    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  100 
 
 		 648 aa  1277    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  37.46 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  34.58 
 
 		 544 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  34.58 
 
 		 544 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  34.58 
 
 		 544 aa  250  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  36.59 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  37.09 
 
 		 490 aa  241  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  34.4 
 
 		 561 aa  233  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  34.72 
 
 		 475 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  32.5 
 
 		 560 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  32.27 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  30.96 
 
 		 486 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  38.33 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  31.44 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  32.9 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  29.27 
 
 		 435 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  43.71 
 
 		 498 aa  167  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  34.81 
 
 		 586 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  35.53 
 
 		 496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  31.16 
 
 		 552 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  39.93 
 
 		 564 aa  143  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  33.79 
 
 		 535 aa  133  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  34.6 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  28.88 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  30.79 
 
 		 456 aa  107  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  35.53 
 
 		 470 aa  98.2  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  35.9 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  26.79 
 
 		 481 aa  48.5  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  27.39 
 
 		 465 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  29.82 
 
 		 474 aa  44.3  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  25.33 
 
 		 488 aa  43.9  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>