40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_6035 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  74.21 
 
 		 560 aa  763    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  90.17 
 
 		 530 aa  889    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  82.75 
 
 		 544 aa  828    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  82.75 
 
 		 544 aa  828    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1114    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  82.75 
 
 		 544 aa  828    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  56.37 
 
 		 519 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  57.11 
 
 		 552 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  55.51 
 
 		 535 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  49.62 
 
 		 586 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  47.67 
 
 		 564 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  42.72 
 
 		 498 aa  286  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  37.62 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  39.92 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  37.9 
 
 		 485 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  34.4 
 
 		 648 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  38.1 
 
 		 475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  34.21 
 
 		 523 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  36.67 
 
 		 496 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  39.64 
 
 		 490 aa  230  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  35.66 
 
 		 435 aa  223  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  38.46 
 
 		 447 aa  221  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  34.26 
 
 		 486 aa  211  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  36.6 
 
 		 456 aa  187  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  32.77 
 
 		 461 aa  184  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  36.01 
 
 		 629 aa  171  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  31.63 
 
 		 470 aa  155  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  34.53 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  28.61 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  25.37 
 
 		 481 aa  79.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  26.47 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  28.34 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  29.41 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  29.68 
 
 		 396 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  29.08 
 
 		 474 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  31.16 
 
 		 401 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0075  putative integral membrane protein  27.96 
 
 		 407 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6076  hypothetical protein  25.93 
 
 		 476 aa  47.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3564  hypothetical protein  29.52 
 
 		 409 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.53184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  27.27 
 
 		 408 aa  44.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.339375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>