34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4525 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1238    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  64.17 
 
 		 648 aa  738    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  34.84 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  34.14 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  34.14 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  34.14 
 
 		 544 aa  239  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  31.06 
 
 		 523 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  35.11 
 
 		 490 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  40.35 
 
 		 485 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  30.72 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  29.77 
 
 		 586 aa  170  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  35.78 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  43.02 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  32.1 
 
 		 496 aa  144  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  33.03 
 
 		 530 aa  143  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  30.71 
 
 		 447 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  39.86 
 
 		 564 aa  138  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  39.61 
 
 		 435 aa  133  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  36.01 
 
 		 561 aa  132  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  38.31 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  28.15 
 
 		 485 aa  130  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  33.33 
 
 		 560 aa  127  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  37.96 
 
 		 535 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  38.39 
 
 		 552 aa  117  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  31.16 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  37.7 
 
 		 510 aa  90.5  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  26.22 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  30.77 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  28.63 
 
 		 465 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  28.74 
 
 		 396 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  28.74 
 
 		 396 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  29.66 
 
 		 401 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  27.27 
 
 		 393 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  26.15 
 
 		 488 aa  45.8  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>