29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7036 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  100 
 
 		 465 aa  933    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  48.48 
 
 		 474 aa  340  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  45.05 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  44.16 
 
 		 481 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  27.33 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  29.83 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  29.5 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  28.87 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  29.08 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  28.47 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  28.7 
 
 		 586 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  29.69 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  28.68 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  28.68 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  28.68 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  28 
 
 		 486 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  29.17 
 
 		 498 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  27.99 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  25.63 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  27.03 
 
 		 552 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  27.63 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  27.98 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  28.57 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  27.42 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  27.39 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  26.88 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  26.58 
 
 		 510 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  29.47 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  26.58 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>