27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4741 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  976    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  46.45 
 
 		 481 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  46.96 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  37.73 
 
 		 474 aa  219  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  29.03 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  25.64 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  28.51 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  28.17 
 
 		 535 aa  93.2  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  29.69 
 
 		 586 aa  81.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  27.05 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  26.22 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  25.73 
 
 		 499 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  25.78 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  25.78 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  25.78 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  27.44 
 
 		 496 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  27.56 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  26.16 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  26.72 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  26.04 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  26.84 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  25.98 
 
 		 552 aa  58.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  26.61 
 
 		 530 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  26.15 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  25.46 
 
 		 560 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  25.2 
 
 		 486 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  26 
 
 		 648 aa  44.3  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>