41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5747 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  73.91 
 
 
560 aa  772    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  83.53 
 
 
530 aa  810    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  100 
 
 
544 aa  1082    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  100 
 
 
544 aa  1082    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  82.75 
 
 
561 aa  774    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  100 
 
 
544 aa  1082    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  55.97 
 
 
519 aa  492  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  58 
 
 
552 aa  473  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  54.86 
 
 
535 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  51.46 
 
 
586 aa  457  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  49.6 
 
 
564 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  42.89 
 
 
498 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  39.72 
 
 
499 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  38 
 
 
485 aa  261  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  35.28 
 
 
523 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  34.58 
 
 
648 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  38.35 
 
 
485 aa  251  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  38.21 
 
 
475 aa  250  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  37.42 
 
 
496 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  39.18 
 
 
447 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  38.52 
 
 
490 aa  223  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  37.8 
 
 
435 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  34.5 
 
 
486 aa  216  9e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  33.33 
 
 
461 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  35.26 
 
 
456 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  33.95 
 
 
510 aa  161  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  33 
 
 
470 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  36.19 
 
 
629 aa  155  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  29.97 
 
 
465 aa  97.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  26.47 
 
 
481 aa  87.4  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  26.2 
 
 
488 aa  84.3  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  30.67 
 
 
474 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  26.98 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3564  hypothetical protein  33.17 
 
 
409 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.53184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  28.72 
 
 
396 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  32.83 
 
 
396 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  32.16 
 
 
401 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4123  hypothetical protein  43.42 
 
 
414 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6076  hypothetical protein  26.51 
 
 
476 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.603696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0075  putative integral membrane protein  26.99 
 
 
407 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  26.14 
 
 
408 aa  43.5  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.339375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>