30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4340 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  100 
 
 		 470 aa  889    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  40.35 
 
 		 486 aa  249  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  38.29 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  34.42 
 
 		 523 aa  232  9e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  34.42 
 
 		 485 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  34.42 
 
 		 496 aa  209  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  40.21 
 
 		 498 aa  200  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  34.69 
 
 		 499 aa  193  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  35.35 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  36.49 
 
 		 519 aa  183  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  36.83 
 
 		 447 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  33.74 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  33.74 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  33.74 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  33.04 
 
 		 475 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  32.67 
 
 		 535 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  31.82 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  32.24 
 
 		 530 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  32.31 
 
 		 561 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  34 
 
 		 552 aa  159  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  32.53 
 
 		 560 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  31.94 
 
 		 586 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  34.55 
 
 		 490 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  32.78 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  32.53 
 
 		 564 aa  133  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  33.69 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  32.45 
 
 		 648 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  32.16 
 
 		 629 aa  109  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  31.22 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.339375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  26.48 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>