22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_26600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  100 
 
 		 408 aa  768    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.339375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  28.95 
 
 		 485 aa  82.8  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  29.78 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  32.57 
 
 		 470 aa  76.3  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  26.82 
 
 		 499 aa  67  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  27.59 
 
 		 496 aa  65.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  27.63 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  32.68 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  28.2 
 
 		 629 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  29.53 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  24.82 
 
 		 485 aa  53.9  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  24.73 
 
 		 523 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  28.54 
 
 		 510 aa  50.4  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  26.11 
 
 		 544 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  26.11 
 
 		 544 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  26.11 
 
 		 544 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  28.44 
 
 		 519 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  34.29 
 
 		 648 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  23.11 
 
 		 530 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  30.81 
 
 		 535 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  26.09 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  27.27 
 
 		 561 aa  43.1  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>