39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0872 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  75.62 
 
 
560 aa  764    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  100 
 
 
530 aa  1055    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  83.53 
 
 
544 aa  835    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  83.53 
 
 
544 aa  835    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  90.17 
 
 
561 aa  863    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  83.53 
 
 
544 aa  835    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  56.32 
 
 
519 aa  480  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  54.8 
 
 
552 aa  472  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  54.91 
 
 
535 aa  451  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  48.74 
 
 
586 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  47.76 
 
 
564 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  43.12 
 
 
498 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  40.16 
 
 
499 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  36.55 
 
 
485 aa  263  4e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  37.57 
 
 
485 aa  256  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  35.37 
 
 
523 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  37.55 
 
 
475 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  39.09 
 
 
490 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  36.48 
 
 
496 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  38.7 
 
 
447 aa  225  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  35.93 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  35.4 
 
 
486 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  34.92 
 
 
456 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  31.91 
 
 
461 aa  171  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  35.63 
 
 
629 aa  160  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  37.32 
 
 
648 aa  160  5e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  32.04 
 
 
470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  33.64 
 
 
510 aa  150  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  27.32 
 
 
465 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  25.85 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  27.42 
 
 
488 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  27.68 
 
 
393 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  28.61 
 
 
474 aa  60.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  28.46 
 
 
396 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  28.34 
 
 
396 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0075  putative integral membrane protein  27.6 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  30.65 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26600  hypothetical protein  27.47 
 
 
408 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.339375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3564  hypothetical protein  28.99 
 
 
409 aa  43.9  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.53184 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>