36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_3096 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_3096  putative integral membrane protein  100 
 
 		 456 aa  895    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.448128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9362  integral membrane protein-like protein  42.72 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3565  integral membrane protein-like protein  42.79 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2134  transmembrane protein  40.1 
 
 		 485 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5074  hypothetical protein  38.85 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23172  hitchhiker  0.000286251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6411  integral membrane protein-like protein  37.87 
 
 		 475 aa  193  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4154  transmembrane protein  35.49 
 
 		 485 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0344  integral membrane protein  33.81 
 
 		 523 aa  173  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.110497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4675  integral membrane protein  36.43 
 
 		 496 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4559  hypothetical protein  39.73 
 
 		 490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.152471  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7035  putative integral membrane protein  40.66 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39350  predicted integral membrane protein  38.07 
 
 		 535 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5070  hypothetical protein  38.24 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522774  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5460  hypothetical protein  35.66 
 
 		 544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.719661  decreased coverage  0.00890455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5747  hypothetical protein  35.66 
 
 		 544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.221882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5371  hypothetical protein  35.66 
 
 		 544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.658284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3921  hypothetical protein  34.53 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09710  hypothetical protein  37.11 
 
 		 461 aa  153  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4744  integral membrane protein-like protein  37.1 
 
 		 586 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0872  hypothetical protein  33.93 
 
 		 530 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10050  transmembrane protein  36.64 
 
 		 560 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6035  hypothetical protein  34.23 
 
 		 561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5379  integral membrane protein-like protein  37.85 
 
 		 564 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4191  hypothetical protein  34.36 
 
 		 552 aa  122  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23290  predicted integral membrane protein  38.83 
 
 		 510 aa  120  7e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4525  hypothetical protein  35.1 
 
 		 629 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4340  integral membrane protein  33.42 
 
 		 470 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7314  putative transmembrane protein  29.6 
 
 		 648 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0174  integral membrane protein-like protein  32.35 
 
 		 396 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0185  integral membrane protein-like protein  32.32 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0166  integral membrane protein-like  31.76 
 
 		 393 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7036  putative integral membrane protein  27.99 
 
 		 465 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4190  hypothetical protein  28.78 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0175  integral membrane protein-like protein  28.81 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.115055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1150  integral membrane protein-like protein  29.11 
 
 		 474 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4741  hypothetical protein  26.32 
 
 		 488 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>