19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3443 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1601  hypothetical protein  70.34 
 
 		 649 aa  734    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.398163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  100 
 
 		 655 aa  1283    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  23.26 
 
 		 623 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  24.72 
 
 		 672 aa  80.9  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  25.84 
 
 		 642 aa  79.7  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  27.67 
 
 		 659 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  24.66 
 
 		 765 aa  63.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4209  hypothetical protein  28.83 
 
 		 688 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1031  hypothetical protein  30.08 
 
 		 893 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  27.84 
 
 		 679 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  30.53 
 
 		 734 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0403  hypothetical protein  28.83 
 
 		 893 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  28.12 
 
 		 653 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  24.75 
 
 		 765 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  29.28 
 
 		 734 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  30.83 
 
 		 705 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  24.26 
 
 		 680 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  26.09 
 
 		 768 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  23.99 
 
 		 751 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>