23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2713 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  100 
 
 
672 aa  1347    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2491  hypothetical protein  71.59 
 
 
543 aa  748    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  36.42 
 
 
642 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  24.85 
 
 
678 aa  164  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  26.08 
 
 
765 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  24.03 
 
 
765 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0884  hypothetical protein  27.47 
 
 
795 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293077  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  23.74 
 
 
679 aa  74.3  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4347  hypothetical protein  24.52 
 
 
630 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  24.6 
 
 
655 aa  65.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  22.77 
 
 
659 aa  57  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  24.87 
 
 
653 aa  55.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  23.73 
 
 
623 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1601  hypothetical protein  29.23 
 
 
649 aa  53.9  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.398163  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  26 
 
 
634 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1941  hypothetical protein  28.29 
 
 
954 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000218078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  30.89 
 
 
826 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2934  hypothetical protein  27.04 
 
 
700 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0421586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1031  hypothetical protein  23.98 
 
 
893 aa  45.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2959  hypothetical protein  26.58 
 
 
946 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.941991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  33.33 
 
 
860 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.460325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  26.92 
 
 
636 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0403  hypothetical protein  28.68 
 
 
893 aa  43.9  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442552  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>