31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0509 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  100 
 
 		 634 aa  1220    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  65.46 
 
 		 636 aa  766    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  30.7 
 
 		 418 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  30.7 
 
 		 418 aa  97.8  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  31.28 
 
 		 434 aa  97.1  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  29.53 
 
 		 520 aa  89  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  28.08 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  29.5 
 
 		 412 aa  73.6  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  27.06 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  31.44 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  29.91 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  28.36 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  35.51 
 
 		 378 aa  62  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  30.08 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  25.4 
 
 		 355 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  29.57 
 
 		 413 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  27.49 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  24.55 
 
 		 394 aa  58.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  29.12 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  29.6 
 
 		 399 aa  57  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 		 714 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  27.86 
 
 		 400 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0221  hypothetical protein  27.63 
 
 		 324 aa  53.9  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.337479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  27.22 
 
 		 672 aa  52  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  32.47 
 
 		 419 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  29.73 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4405  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  33.12 
 
 		 705 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2145  hypothetical protein  24.69 
 
 		 393 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  20.26 
 
 		 379 aa  44.3  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  25.61 
 
 		 419 aa  44.3  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>