26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4104 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  805    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  34.93 
 
 		 373 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  29.03 
 
 		 636 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  31.02 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  28.57 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  33.2 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  30.15 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  30.15 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  28.87 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  32.24 
 
 		 634 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  37.11 
 
 		 520 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  29.78 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  34.55 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  28.14 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  32.77 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  33.19 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  29.08 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  29.44 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  31.19 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  35.84 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  31 
 
 		 404 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  21.03 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  33.59 
 
 		 714 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  27.31 
 
 		 354 aa  47  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  33.33 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  32.26 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>