19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1450 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  99.76 
 
 
418 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  47.95 
 
 
434 aa  347  3e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  31.98 
 
 
636 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  30.7 
 
 
634 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  31.54 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  30.15 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  29.63 
 
 
373 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  30.41 
 
 
413 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  25.27 
 
 
379 aa  47.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  27.86 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  23.75 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0221  hypothetical protein  28.32 
 
 
324 aa  47.8  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.337479  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  29.38 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  26.79 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2926  putative integral membrane protein  33.33 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000584456 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  26.94 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  26.63 
 
 
520 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  24.47 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>