14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4416 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  100 
 
 		 415 aa  813    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  83.13 
 
 		 412 aa  663    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  30.74 
 
 		 520 aa  97.1  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  31.51 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  31.03 
 
 		 636 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  25.88 
 
 		 634 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  30.81 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  25.71 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  37 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  31.06 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  33.99 
 
 		 714 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  25 
 
 		 399 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  35.1 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>