31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2034 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  100 
 
 
520 aa  1021    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  30.77 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  30.74 
 
 
412 aa  117  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  29.14 
 
 
636 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  31.15 
 
 
388 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  34.4 
 
 
634 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  29.89 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  29.18 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  32.02 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  28.63 
 
 
434 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  35.58 
 
 
714 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  31.82 
 
 
399 aa  73.2  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2145  hypothetical protein  25.97 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  24.25 
 
 
379 aa  69.7  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  29.83 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  28.32 
 
 
419 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  33.58 
 
 
378 aa  63.9  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  28.12 
 
 
355 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  29.57 
 
 
413 aa  63.9  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  28.81 
 
 
400 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04850  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 
423 aa  56.2  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  26.63 
 
 
418 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  26.63 
 
 
418 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4405  putative lipoprotein  32.89 
 
 
454 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  29.58 
 
 
428 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  27.63 
 
 
407 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  27.16 
 
 
389 aa  47  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  27.71 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  29.77 
 
 
394 aa  45.8  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  29.25 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2926  putative integral membrane protein  28.96 
 
 
394 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000584456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>