28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8168 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  100 
 
 		 413 aa  820    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  30.87 
 
 		 419 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  35.03 
 
 		 407 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  31.99 
 
 		 389 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  29.21 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  28.89 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  39.32 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  25.99 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  28.8 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  27.55 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2926  putative integral membrane protein  30.41 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000584456 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  29.91 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  29.17 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  29.17 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  29.57 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  28.91 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  30.99 
 
 		 373 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  28.77 
 
 		 636 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  32.54 
 
 		 378 aa  53.9  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  24.86 
 
 		 379 aa  53.1  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  29.68 
 
 		 385 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  25.95 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  31 
 
 		 714 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  31.87 
 
 		 634 aa  50.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  28.22 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  25.69 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  27.48 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1002  putative integral membrane protein  30.72 
 
 		 465 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.604379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>