22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0343 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  687    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  43.81 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  42.17 
 
 		 373 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  42.6 
 
 		 385 aa  196  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  42.41 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  37.96 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  29.79 
 
 		 419 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  28.86 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  30.57 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  26.84 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  28.71 
 
 		 636 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  25.72 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  29.31 
 
 		 634 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  30.45 
 
 		 520 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  29.4 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  22.07 
 
 		 379 aa  50.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  25 
 
 		 412 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  25 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04850  conserved hypothetical protein  28.66 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  32.26 
 
 		 714 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  26.58 
 
 		 418 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  25.96 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>