21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4954 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  773    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  50.92 
 
 
373 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  50.15 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  42.12 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  36.34 
 
 
404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  37.28 
 
 
385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  33.61 
 
 
412 aa  77  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  33.03 
 
 
636 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  34.45 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  29 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  31.82 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2145  hypothetical protein  31.93 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  34.07 
 
 
388 aa  62.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  25 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  24.54 
 
 
412 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  24.89 
 
 
418 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  24.89 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  26.21 
 
 
419 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  29.82 
 
 
634 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  28.9 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  35.85 
 
 
714 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>