20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7313 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  100 
 
 
404 aa  776    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  72.51 
 
 
385 aa  481  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  43.15 
 
 
355 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  39.3 
 
 
373 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  36.34 
 
 
399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  34.97 
 
 
394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  26.8 
 
 
636 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  29.89 
 
 
520 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  29.91 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  30.8 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  35.54 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  26.21 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  28.33 
 
 
634 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  25 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  26.49 
 
 
389 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  33.51 
 
 
388 aa  50.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  23.81 
 
 
418 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  23.81 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  31.79 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  25.08 
 
 
415 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.683646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>