20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1299 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  872    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  47.95 
 
 
418 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  47.95 
 
 
418 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  29.2 
 
 
636 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  31.28 
 
 
634 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  28.63 
 
 
520 aa  60.1  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  25 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  34.55 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  30.33 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  30 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  25.24 
 
 
379 aa  49.7  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  28.19 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  30.88 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  27.96 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4405  putative lipoprotein  32.62 
 
 
454 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  28.22 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  25.65 
 
 
385 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  26.92 
 
 
419 aa  45.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  25.69 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1002  putative integral membrane protein  28.65 
 
 
465 aa  43.1  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.604379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>