27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0756 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  692    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  37.95 
 
 
388 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  29.62 
 
 
418 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  29.62 
 
 
418 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  33.33 
 
 
636 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  30.37 
 
 
520 aa  90.1  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  30.25 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  34.96 
 
 
407 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  36.89 
 
 
634 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  30.99 
 
 
415 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  31.61 
 
 
434 aa  76.6  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  32.17 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  26.03 
 
 
379 aa  73.9  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  32.75 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  31.56 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  33.19 
 
 
385 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  30.53 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  32.43 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  31.86 
 
 
389 aa  59.7  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  36.42 
 
 
714 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  28.31 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  29.44 
 
 
428 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  29.73 
 
 
354 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2145  hypothetical protein  28.15 
 
 
393 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  29.81 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  35.29 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2926  putative integral membrane protein  35.96 
 
 
394 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000584456 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>