18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2926 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2926  putative integral membrane protein  100 
 
 		 394 aa  736    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000584456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1002  putative integral membrane protein  46.94 
 
 		 465 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.604379 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  35.19 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  35.22 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  41.84 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  30.41 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  31.11 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  38.01 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  53.06 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  31.58 
 
 		 389 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  36.05 
 
 		 378 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  28.89 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  28.89 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  29.57 
 
 		 434 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  35.12 
 
 		 714 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  28.96 
 
 		 520 aa  45.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  36.21 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  38.79 
 
 		 400 aa  43.1  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>