17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2798 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  100 
 
 
428 aa  849    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  71.33 
 
 
419 aa  546  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  35.86 
 
 
413 aa  166  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1002  putative integral membrane protein  35.7 
 
 
465 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.604379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2926  putative integral membrane protein  34.18 
 
 
394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000584456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  29.45 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  28.11 
 
 
419 aa  65.1  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  28.19 
 
 
434 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  26.29 
 
 
389 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  24.47 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  24.47 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  30.25 
 
 
354 aa  50.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  32.17 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  31.54 
 
 
636 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  27.42 
 
 
407 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  29.58 
 
 
520 aa  43.5  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  30.72 
 
 
378 aa  43.1  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>