13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2518 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2518  integral membrane protein  100 
 
 
419 aa  821    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000140581 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  71.33 
 
 
428 aa  570  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  34.34 
 
 
413 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2926  putative integral membrane protein  34.48 
 
 
394 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000584456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1002  putative integral membrane protein  37.04 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.604379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  30.12 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  29.63 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  27.83 
 
 
389 aa  53.9  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  26.89 
 
 
434 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  28.78 
 
 
418 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  28.78 
 
 
418 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  28.34 
 
 
407 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  26.96 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>