29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5897 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  742    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  30.91 
 
 
520 aa  106  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  32.05 
 
 
415 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  31.02 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  30.63 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  31.38 
 
 
636 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  40.19 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  31.31 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  32.12 
 
 
634 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  32.26 
 
 
373 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  35.04 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  40.14 
 
 
714 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  31.67 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  29.54 
 
 
355 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  27.35 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  27.35 
 
 
418 aa  69.7  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  29.14 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  29.92 
 
 
407 aa  67  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  34.96 
 
 
399 aa  66.2  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  33.99 
 
 
404 aa  62.8  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2760  hypothetical protein  28.14 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.244936  normal  0.566037 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  27.27 
 
 
379 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  32.1 
 
 
385 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  26.85 
 
 
419 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  32.56 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2798  integral membrane protein  32.17 
 
 
428 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.495574  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4405  putative lipoprotein  33.33 
 
 
454 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1147  integral membrane protein  30.61 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.470141  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0278  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0115898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>