15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2651 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2651  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.589056  normal  0.0568929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4900  FHA domain-containing protein  66.98 
 
 		 714 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542451  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  28.08 
 
 		 636 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  33.93 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  31.82 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  29.41 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  30.61 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  36.84 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  28.66 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  34.81 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  35.1 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  34.38 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  33.77 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  31.68 
 
 		 634 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0770  hypothetical protein  24.68 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00310249  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>