21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4524 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4524  hypothetical protein  100 
 
 		 385 aa  743    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.446454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7313  hypothetical protein  72.51 
 
 		 404 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0829042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0343  hypothetical protein  40.62 
 
 		 355 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0680125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9361  hypothetical protein  38.62 
 
 		 373 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4954  hypothetical protein  35.14 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3401  hypothetical protein  34.2 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3626  hypothetical protein  27.33 
 
 		 636 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.19482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4104  hypothetical protein  28.57 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0645227  normal  0.27288 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2034  integral membrane protein-like  29.64 
 
 		 520 aa  70.1  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.247386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1299  hypothetical protein  27.35 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.991942  normal  0.99537 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0509  hypothetical protein  27.49 
 
 		 634 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8168  integral membrane protein  29.68 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0216  hypothetical protein  30.84 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3984  hypothetical protein  27.98 
 
 		 419 aa  54.3  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4416  hypothetical protein  24.52 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683646 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0761  hypothetical protein  23.47 
 
 		 412 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0543592 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1476  putative integral membrane protein  23.78 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.725298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0756  hypothetical protein  32.14 
 
 		 378 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.450216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5897  hypothetical protein  37.23 
 
 		 388 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1450  hypothetical protein  23.78 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0461  hypothetical protein  26.2 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0181913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>