18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3885 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  80.39 
 
 
765 aa  1234    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  100 
 
 
765 aa  1518    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0884  hypothetical protein  40.41 
 
 
795 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293077  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  34.41 
 
 
678 aa  339  9e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  25.97 
 
 
642 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  23.62 
 
 
672 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2491  hypothetical protein  27.8 
 
 
543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  26.72 
 
 
679 aa  72  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  23.67 
 
 
653 aa  69.7  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3818  hypothetical protein  35.71 
 
 
640 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00672536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  26.1 
 
 
659 aa  54.7  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2934  hypothetical protein  26.21 
 
 
700 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0421586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1618  hypothetical protein  29.68 
 
 
755 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  30.22 
 
 
751 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  23.18 
 
 
623 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  27.78 
 
 
735 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4347  hypothetical protein  24.44 
 
 
630 aa  45.1  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3825  hypothetical protein  27.33 
 
 
959 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.501815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>