16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3206 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  100 
 
 		 679 aa  1316    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2934  hypothetical protein  65.65 
 
 		 700 aa  833    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0421586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  34.84 
 
 		 659 aa  246  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3818  hypothetical protein  32.04 
 
 		 640 aa  196  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00672536  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  27 
 
 		 765 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  25.99 
 
 		 653 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  24.5 
 
 		 672 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  26.67 
 
 		 765 aa  75.1  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  24.04 
 
 		 678 aa  58.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  25.52 
 
 		 655 aa  57  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  31.25 
 
 		 642 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  28.36 
 
 		 768 aa  47.4  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  31.87 
 
 		 751 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0884  hypothetical protein  25.95 
 
 		 795 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293077  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1618  hypothetical protein  39.34 
 
 		 755 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0440  hypothetical protein  31.82 
 
 		 705 aa  43.9  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>