18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1331 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  100 
 
 
751 aa  1461    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1618  hypothetical protein  68.18 
 
 
755 aa  885    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  41.77 
 
 
653 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4347  hypothetical protein  34.33 
 
 
630 aa  205  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  24.09 
 
 
642 aa  60.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  35.24 
 
 
659 aa  54.3  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2491  hypothetical protein  22.5 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  27.98 
 
 
765 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  23.04 
 
 
679 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  31.17 
 
 
869 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  30.29 
 
 
734 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  27.46 
 
 
765 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  22.69 
 
 
672 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  21.67 
 
 
678 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  34.74 
 
 
827 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  31.17 
 
 
623 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  29.03 
 
 
655 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3630  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
680 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>