17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0854 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  100 
 
 		 765 aa  1508    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  80.39 
 
 		 765 aa  1241    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0884  hypothetical protein  41.6 
 
 		 795 aa  510  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293077  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  35.64 
 
 		 678 aa  347  6e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  25.16 
 
 		 672 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2491  hypothetical protein  27.75 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  25.98 
 
 		 642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  27.39 
 
 		 679 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2934  hypothetical protein  28.9 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0421586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  23.76 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  27.62 
 
 		 659 aa  57.4  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1618  hypothetical protein  30.22 
 
 		 755 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  29.5 
 
 		 751 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4803  hypothetical protein  23.22 
 
 		 623 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0267485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3818  hypothetical protein  38.32 
 
 		 640 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00672536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4347  hypothetical protein  21.22 
 
 		 630 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3443  hypothetical protein  22.83 
 
 		 655 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.047188  normal  0.0829627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>