12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2934 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  65.65 
 
 
679 aa  840    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2934  hypothetical protein  100 
 
 
700 aa  1357    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0421586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  31.98 
 
 
659 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3818  hypothetical protein  29.96 
 
 
640 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00672536  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  25.41 
 
 
653 aa  91.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  29.62 
 
 
765 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  26.23 
 
 
765 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0884  hypothetical protein  27.31 
 
 
795 aa  53.5  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293077  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  25 
 
 
642 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  22.29 
 
 
678 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1618  hypothetical protein  33.59 
 
 
755 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  27.04 
 
 
672 aa  45.1  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>