15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1618 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1331  hypothetical protein  68.18 
 
 
751 aa  907    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1618  hypothetical protein  100 
 
 
755 aa  1461    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2705  hypothetical protein  41.39 
 
 
653 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4347  hypothetical protein  34.87 
 
 
630 aa  214  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954065  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2231  hypothetical protein  34.29 
 
 
659 aa  55.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2491  hypothetical protein  23.73 
 
 
543 aa  55.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  25.59 
 
 
642 aa  54.3  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0854  hypothetical protein  30.22 
 
 
765 aa  52.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5033  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2713  hypothetical protein  25 
 
 
672 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0108305  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3206  hypothetical protein  36.26 
 
 
679 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0193286 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  29.68 
 
 
765 aa  50.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4269  hypothetical protein  22.37 
 
 
678 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0936509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2934  hypothetical protein  33.7 
 
 
700 aa  45.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0421586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  36.03 
 
 
827 aa  44.3  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  28.05 
 
 
734 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>