21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0029 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0779  glycosyl transferase family protein  70.16 
 
 		 687 aa  937    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0029  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 687 aa  1363    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.642435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3865  hypothetical protein  26.43 
 
 		 860 aa  98.6  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.460325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  25.98 
 
 		 869 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  27.85 
 
 		 826 aa  78.2  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1597  hypothetical protein  24.75 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1122  hypothetical protein  22.24 
 
 		 680 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.180103  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2869  glycosyl transferase family 39  29.23 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0447081  normal  0.0253035 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3252  glycosyl transferase family 39  29.23 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1913  glycosyl transferase family 39  27.53 
 
 		 528 aa  51.2  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.100908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1792  glycosyl transferase family 39  32.39 
 
 		 528 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2984  glycosyl transferase family 39  26.85 
 
 		 553 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.117969  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2192  dolichyl-phosphate-mannose-protein mannosyltransferase family protein  27.05 
 
 		 447 aa  47.4  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0887  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 554 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00658553  hitchhiker  0.00000000299113 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1617  hypothetical protein  24.58 
 
 		 531 aa  47  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4509  glycosyl transferase family 39  32.87 
 
 		 655 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.256832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3524  glycosyl transferase family 39  30.43 
 
 		 536 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2829  Tetratricopeptide TPR_4  36.04 
 
 		 710 aa  45.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2417  glycosyl transferase family 39  29.06 
 
 		 658 aa  45.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0533  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 557 aa  45.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3427  glycosyl transferase family 39  29.93 
 
 		 323 aa  44.3  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>