25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4276 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4276  hypothetical protein  100 
 
 
735 aa  1481    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00531849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2505  hypothetical protein  30.24 
 
 
768 aa  242  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2725  hypothetical protein  29.45 
 
 
698 aa  120  7.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01280  hypothetical protein  24.9 
 
 
576 aa  92  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.292249  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2508  hypothetical protein  25.09 
 
 
649 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0564678  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0994  hypothetical protein  25.56 
 
 
515 aa  85.5  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1027  hypothetical protein  25.66 
 
 
515 aa  84.3  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2115  hypothetical protein  25.64 
 
 
486 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1411  hypothetical protein  25.46 
 
 
303 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00357704  normal  0.0994638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1163  hypothetical protein  28.61 
 
 
636 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.416407  normal  0.739932 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2617  unknown, LphB  21.84 
 
 
547 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2744  unknown, LphB  22.45 
 
 
546 aa  57.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13839  transmembrane protein  29.79 
 
 
627 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.240396  normal  0.0556328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5104  hypothetical protein  28.85 
 
 
676 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5016  hypothetical protein  28.85 
 
 
676 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.978148  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5397  hypothetical protein  28.85 
 
 
676 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.71515  normal  0.180581 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4300  hypothetical protein  26.74 
 
 
869 aa  50.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0442  hypothetical protein  28.28 
 
 
826 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.186794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3885  hypothetical protein  27.17 
 
 
765 aa  49.3  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.848527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28170  hypothetical protein  23.6 
 
 
601 aa  48.9  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2055  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
729 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.265911 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3907  hypothetical protein  26.95 
 
 
725 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2471  hypothetical protein  27.87 
 
 
776 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3210  hypothetical protein  27.78 
 
 
709 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0565675  normal  0.603681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1851  hypothetical protein  28.57 
 
 
642 aa  44.3  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>