53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1656 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 229 aa  456  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  74.89 
 
 		 219 aa  339  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  51.07 
 
 		 229 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  38.03 
 
 		 227 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  30.53 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  29.93 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  35.54 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  26.35 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  28.48 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  27.43 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  28.49 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  28.49 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  28.49 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  33.73 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  34.94 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.05 
 
 		 170 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  25.53 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  29.13 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  25.61 
 
 		 155 aa  52.4  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  26.54 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  26.67 
 
 		 283 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  28.46 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  28.47 
 
 		 172 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  29.13 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  24.85 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  31.52 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  24.22 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  31.76 
 
 		 155 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  23.64 
 
 		 180 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  24.68 
 
 		 175 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 		 174 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  30.43 
 
 		 170 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  28.17 
 
 		 179 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  31.43 
 
 		 155 aa  45.1  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  34.18 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  30.49 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  25.48 
 
 		 176 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  26.39 
 
 		 479 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  32.2 
 
 		 172 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  28.09 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  26.02 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0806  hypothetical protein  26.75 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.335082  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  25.22 
 
 		 170 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  22.98 
 
 		 175 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  22.98 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  22.88 
 
 		 245 aa  42.7  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  23.72 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  28.24 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  29.67 
 
 		 126 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2589  hypothetical protein  27.27 
 
 		 332 aa  42  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3874  hypothetical protein  48.78 
 
 		 350 aa  41.6  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>