237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1586 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1586  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.600595  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0944  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  85.92 
 
 
277 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4450  hypothetical protein  43.24 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0210  hypothetical protein  37.22 
 
 
281 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6275  hypothetical protein  34.43 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1808  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  35.63 
 
 
302 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.72827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2467  hypothetical protein  38.3 
 
 
292 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4313  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  32.5 
 
 
261 aa  89.7  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.678939  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1509  hypothetical protein  27.56 
 
 
218 aa  86.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00164227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5227  beta-lactamase domain protein  29.55 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  28.63 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3589  beta-lactamase domain protein  30 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  28.63 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2823  beta-lactamase domain-containing protein  28.32 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00166686  hitchhiker  0.00150789 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2131  hypothetical protein  35.75 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.605971  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2540  hypothetical protein  28.62 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.641788  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2596  beta-lactamase domain protein  27.43 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477747  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2496  hypothetical protein  27.31 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1421  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.831543  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1805  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  31.35 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1220  hypothetical protein  27.65 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000702684 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4386  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.81 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1271  hypothetical protein  30.6 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384497  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6159  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  27.8 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.0786159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0545  hypothetical protein  27.71 
 
 
223 aa  70.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0125992 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0288  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.51 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0981  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  25.48 
 
 
355 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1819  hypothetical protein  28.02 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5759  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.91 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.774373 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4722  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.55 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1645  hypothetical protein  27.19 
 
 
223 aa  69.7  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.787985 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1075  beta-lactamase domain protein  29.28 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0220029  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6004  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.35 
 
 
374 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.829765  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4663  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.55 
 
 
354 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.832846 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  26.88 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04059  predicted L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.19 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4800  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.55 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4650  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.55 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4779  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.55 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.524787  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4660  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.55 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0154  hypothetical protein  27.88 
 
 
214 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.61111  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4743  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.55 
 
 
354 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04021  hypothetical protein  24.19 
 
 
354 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7735  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like  26.46 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1324  putative L-ascorbate-6-phosphate lactonase UlaG  21.26 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4436  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.19 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4752  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.19 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3821  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.19 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  30.06 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5708  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.19 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6668  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.91 
 
 
374 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.253593  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3801  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  24.73 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2649  hypothetical protein  26.01 
 
 
376 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3423  hypothetical protein  24.79 
 
 
367 aa  65.5  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0456892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1344  metal-dependent hydrolase  25.4 
 
 
228 aa  65.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.181884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0643  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  23.42 
 
 
354 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0119  putative L-ascorbate 6-phosphate lactonase  23.64 
 
 
355 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3291  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.841788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1705  beta-lactamase-like  28.57 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1221  hypothetical protein  26.01 
 
 
376 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5824  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like  26.91 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2256  Zn-dependent hydrolase  24.6 
 
 
348 aa  64.7  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6189  Zn-dependent hydrolases of the beta-lactamase fold-like protein  26.91 
 
 
374 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.613218  normal  0.612228 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4333  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 
241 aa  65.5  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.72 
 
 
386 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1640  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.71 
 
 
325 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0816  beta-lactamase domain-containing protein  29.72 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3728  hypothetical protein  25.21 
 
 
356 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000279233 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1261  beta-lactamase-like protein  28.41 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.191714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0215  beta-lactamase domain protein  24.89 
 
 
409 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0810  metal-dependent hydrolase  26.01 
 
 
225 aa  63.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0516  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  29.87 
 
 
590 aa  63.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05497  hypothetical protein  25.56 
 
 
362 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.428676 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5420  hypothetical protein  26.46 
 
 
381 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3741  hypothetical protein  25.22 
 
 
363 aa  63.5  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0499981  normal  0.188301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0291  hypothetical protein  25.22 
 
 
356 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.619588  hitchhiker  0.0000166139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2809  hypothetical protein  29.49 
 
 
335 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14470  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  26.8 
 
 
365 aa  62.4  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0785  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1154  hypothetical protein  27.87 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0298  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.35 
 
 
362 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1740  metal-dependent hydrolase  26.95 
 
 
228 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0849685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1463  hypothetical protein  25.11 
 
 
383 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8446  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.9 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0793  outer membrane protein RomA  23.72 
 
 
358 aa  60.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1886  hypothetical protein  26.01 
 
 
380 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31105  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0136  metal-dependent hydrolase  28.29 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4432  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.69 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0167482  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1677  beta-lactamase domain-containing protein  25.87 
 
 
367 aa  60.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0836093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0449  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  25.44 
 
 
376 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1348  metal-dependent hydrolase  25.4 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.324127  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1063  beta-lactamase domain protein  31.32 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.476054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4201  beta-lactamase domain-containing protein  28.85 
 
 
227 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1697  hypothetical protein  27.42 
 
 
211 aa  60.1  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0295  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold  23.87 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1816  beta-lactamase domain-containing protein  25.6 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.604126  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3902  hypothetical protein  25.6 
 
 
371 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1628  hypothetical protein  25.86 
 
 
221 aa  59.7  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  26.15 
 
 
356 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>