82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1429 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1429  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  540  1e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3963  ribokinase-like domain-containing protein  77.94 
 
 		 272 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1200  PfkB domain protein  50 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.460127  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  38.55 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0143  ribokinase-like domain-containing protein  38.22 
 
 		 259 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  39.36 
 
 		 284 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  37.65 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3183  PfkB domain protein  38.55 
 
 		 284 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  36.02 
 
 		 283 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  24.29 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  42 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  25.86 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  25.09 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  38.26 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  28.36 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  39.73 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  24.01 
 
 		 297 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  41.96 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 		 314 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  34.69 
 
 		 308 aa  48.9  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  27.35 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  36.49 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  26.32 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  33.05 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  26.79 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 313 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  38.14 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  36.08 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  36.11 
 
 		 309 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  35.88 
 
 		 295 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0716  rfaE bifunctional protein  37.14 
 
 		 333 aa  45.8  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.511736  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  35.62 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  30.25 
 
 		 403 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  36.08 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  36.08 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  27.12 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  36.08 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  25.37 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1734  ribokinase-like domain-containing protein  30.53 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.264913  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  43.82 
 
 		 295 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  36.59 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01080  sugar kinase, ribokinase  40.19 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  24.25 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  29.38 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  39.47 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 325 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  30.77 
 
 		 424 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  39.47 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  39.47 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  39.47 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  41.67 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  26.55 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  39.6 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  25.81 
 
 		 312 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  36.99 
 
 		 299 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  34.52 
 
 		 309 aa  42.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.35 
 
 		 319 aa  42.7  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  37.21 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 298 aa  42.7  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1960  putative regulatory protein  36.84 
 
 		 408 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000520335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1789  putative regulatory protein, DeoR family  36.84 
 
 		 408 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  24.49 
 
 		 305 aa  42.4  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1479  putative regulatory protein DeoR family  36.84 
 
 		 408 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.255884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1516  putative regulatory protein  36.84 
 
 		 408 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115936  hitchhiker  0.000000147446 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1495  putative regulatory protein  36.84 
 
 		 408 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.943692  hitchhiker  0.0000000000000150767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  42.31 
 
 		 337 aa  42.7  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  23.72 
 
 		 403 aa  42.7  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  24.52 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0560  ribokinase  34.69 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000679387  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  36.36 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1119  ribokinase  40.7 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.970785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  34.86 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  50 
 
 		 318 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  38.24 
 
 		 330 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  39.74 
 
 		 337 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  39.47 
 
 		 298 aa  42  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  39.74 
 
 		 337 aa  42  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  45.28 
 
 		 305 aa  42  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  31.15 
 
 		 284 aa  42  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>