47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0299 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0299  putative prolin-rich signal peptide protein  100 
 
 		 355 aa  697    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.747648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0153  putative proline-rich signal peptide protein  67.77 
 
 		 360 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0160  putative prolin-rich signal peptide protein  65.36 
 
 		 344 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0194  hypothetical protein  41.89 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2963  hypothetical protein  38.89 
 
 		 457 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6257  hypothetical protein  40.8 
 
 		 426 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.65931 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2929  hypothetical protein  40.46 
 
 		 418 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.688656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0390  hypothetical protein  49.33 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2914  hypothetical protein  40.17 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336467  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4237  hypothetical protein  45.73 
 
 		 433 aa  212  7e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2300  hypothetical protein  39.88 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0480  hypothetical protein  46.84 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0589593 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2826  hypothetical protein  45.64 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.378157 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0360  hypothetical protein  39.24 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0079  hypothetical protein  48.05 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.480187  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3216  hypothetical protein  48.05 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.553714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0416  hypothetical protein  47.86 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1347  hypothetical protein  48.05 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.028255  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0247  hypothetical protein  48.05 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.931607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0598  hypothetical protein  47.86 
 
 		 439 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158008  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0436  hypothetical protein  47.86 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0114  putative prolin-rich signal peptide protein  50.44 
 
 		 326 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0083  hypothetical protein  47.77 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0961  hypothetical protein  35.09 
 
 		 324 aa  125  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.78766  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0444  hypothetical protein  32.42 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0301  hypothetical protein  30.49 
 
 		 396 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4784  hypothetical protein  32.11 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0507108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3265  hypothetical protein  34.98 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.135522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3631  putative proline-rich signal peptide protein  33.87 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.237393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0595  hypothetical protein  33.18 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.190253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3060  hypothetical protein  30.62 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.730904  normal  0.217511 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0447  hypothetical protein  26.55 
 
 		 404 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0612  hypothetical protein  30.66 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0740  hypothetical protein  27.93 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0990  hypothetical protein  29 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0438  hypothetical protein  25.15 
 
 		 404 aa  53.5  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.137031  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0514  hypothetical protein  26.51 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0265  hypothetical protein  27.23 
 
 		 400 aa  51.2  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0299204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1124  hypothetical protein  26.39 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1221  hypothetical protein  24.77 
 
 		 236 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2664  hypothetical protein  24.69 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30.84 
 
 		 2179 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2998  hypothetical protein  24.61 
 
 		 238 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.419012  hitchhiker  0.000284542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3160  hypothetical protein  30 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  31.73 
 
 		 2272 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2665  hypothetical protein  25.35 
 
 		 232 aa  42.7  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36910  hypothetical protein  24.44 
 
 		 238 aa  42.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>