140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3508 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3508  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 440 aa  887    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3153  acetamidase/formamidase  99.55 
 
 		 440 aa  884    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.121817 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4177  acetamidase/formamidase  83.41 
 
 		 438 aa  751    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2184  Acetamidase/Formamidase  60.98 
 
 		 434 aa  550  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1338  Acetamidase/Formamidase  60.75 
 
 		 434 aa  545  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.702518  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3284  Acetamidase/Formamidase  64.65 
 
 		 443 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.148354  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1872  Acetamidase/Formamidase  58.14 
 
 		 429 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2080  acetamidase/formamidase  52.35 
 
 		 438 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5699  acetamidase/formamidase  51.15 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2642  Acetamidase/Formamidase  50.82 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0651  Acetamidase/Formamidase  49.54 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2016  Acetamidase/Formamidase  49.42 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.62129 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  30.99 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0965  formamidase  36.36 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0855422  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  35.4 
 
 		 304 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  30.86 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2668  Acetamidase/Formamidase  31.48 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.896423  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  40.3 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2654  acetamidase/formamidase family protein  33.63 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00018513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  30.86 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  31.62 
 
 		 304 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2541  acetamidase/formamidase  44.12 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3981  Acetamidase/Formamidase  31.25 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  27.5 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5754  Acetamidase/Formamidase  31.75 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  32.74 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  32.74 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  32.74 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2755  acetamidase/formamidase family protein  32.74 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000518769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  32.74 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  33.02 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0412  Acetamidase/Formamidase  41.79 
 
 		 301 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  32.71 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  29.73 
 
 		 299 aa  57  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  31.03 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  24.73 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  29.93 
 
 		 304 aa  55.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  26.7 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  26.7 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  25.44 
 
 		 485 aa  54.7  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  27.34 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  28.68 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  30.25 
 
 		 314 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  26.7 
 
 		 379 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  29.41 
 
 		 311 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  44.12 
 
 		 300 aa  53.9  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  25.93 
 
 		 498 aa  53.5  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2307  acetamidase/formamidase  32.73 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213262  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  29.6 
 
 		 303 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  32.73 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2066  acetamidase/formamidase  32.73 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00155819  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5506  formamidase  41.89 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2320  Acetamidase/Formamidase  32.73 
 
 		 429 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.167925  hitchhiker  0.000147779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  25.65 
 
 		 456 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  33.33 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1598  Formamidase  36.49 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.52036  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  27.17 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  34.51 
 
 		 363 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  27.17 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3860  formamidase  39.19 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  26.04 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3375  formamidase  40.54 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0598  formamidase  40.54 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.412035  normal  0.0121636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3566  Formamidase  40.54 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3684  Formamidase  40.54 
 
 		 409 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  44.78 
 
 		 298 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  36.67 
 
 		 303 aa  50.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  27.17 
 
 		 479 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3569  formamidase  40.68 
 
 		 408 aa  49.7  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.704003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  24.4 
 
 		 413 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  30.3 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0981  formamidase  30.56 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.068454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  25.32 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1257  formamidase  36.49 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.66975  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3859  formamidase  36.49 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  38.81 
 
 		 322 aa  49.3  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0659  formamidase (formamide amidohydrolase)  37.84 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190134  normal  0.386066 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3110  Formamidase  33.02 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  38.46 
 
 		 328 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  27.54 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  31.78 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  27.34 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1448  Formamidase  36.49 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  27.73 
 
 		 314 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  32.64 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4073  formamidase  39.19 
 
 		 410 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398995  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  39.34 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1777  formamidase  32.08 
 
 		 406 aa  47.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00161545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 844 aa  47.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  39.34 
 
 		 319 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 810 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1706  formamidase (FmdA)  37.84 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  41.38 
 
 		 373 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  39.34 
 
 		 319 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  41.54 
 
 		 350 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  25.23 
 
 		 320 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04577  FormamidasePutative uncharacterized protein (EC 3.5.1.49); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9C453]  41.67 
 
 		 411 aa  47.4  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.469129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5199  Formamidase  35.9 
 
 		 417 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  36.99 
 
 		 312 aa  47.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>