51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2898 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2898  DNA polymerase III subunit chi  100 
 
 		 152 aa  299  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1542  DNA polymerase III subunit chi  95.27 
 
 		 148 aa  265  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1123  DNA polymerase III subunit chi  91.89 
 
 		 158 aa  250  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.144484 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0951  DNA polymerase III subunit chi  58.17 
 
 		 154 aa  173  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1192  DNA polymerase III subunit chi  58.94 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.369571  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1816  DNA polymerase III subunit chi  56.95 
 
 		 154 aa  167  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0904  DNA polymerase III subunit chi  55.33 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.0444908 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2532  DNA polymerase III subunit chi  48.65 
 
 		 153 aa  120  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1071  DNA polymerase III subunit chi  45.03 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300833  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1215  DNA polymerase III subunit chi  44.37 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793158  decreased coverage  0.00000089411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5564  DNA polymerase III chi subunit HolC  45.03 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0767  DNA polymerase III subunit chi  43.05 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.100717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3108  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.06 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1228  DNA polymerase III subunit chi  42.67 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.022673  normal  0.528347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5406  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.05 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2599  DNA polymerase III subunit chi  41.06 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3336  DNA polymerase III chi subunit HolC  44.08 
 
 		 149 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.836829  normal  0.366639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2220  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.62 
 
 		 151 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1755  DNA polymerase III subunit chi  40.4 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1459  DNA polymerase III chi subunit HolC  43.23 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176119  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0690  DNA polymerase III subunit chi  39.07 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.435685  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0681  DNA polymerase III subunit chi  39.07 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5197  DNA polymerase III chi subunit HolC  41.06 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5119  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.4 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.225857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4656  DNA polymerase III chi subunit HolC  40.4 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.39691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1546  hypothetical protein  40.52 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3469  DNA polymerase III subunit chi  37.33 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0975946  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0509  DNA polymerase III subunit chi  34.44 
 
 		 149 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0649  DNA polymerase III chi subunit HolC  36.84 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3053  DNA polymerase III subunit chi  40 
 
 		 148 aa  90.5  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00465951  normal  0.254761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2964  DNA polymerase III subunit chi  37.09 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0488849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2482  DNA polymerase III subunit chi  36 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2200  DNA polymerase III subunit chi  38.56 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99694  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1675  DNA polymerase III subunit chi  35.33 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2338  DNA polymerase III subunit chi  34.21 
 
 		 151 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.695498  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3833  DNA polymerase III subunit chi  35.33 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.543729  normal  0.516031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2315  DNA polymerase III subunit chi  33.33 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1760  DNA polymerase III chi subunit, HolC  35.53 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.248736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2411  DNA polymerase III subunit chi  45.7 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0892  DNA polymerase III chi subunit, HolC  36.3 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2675  DNA polymerase III, chi subunit  31.82 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000802789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0579  DNA polymerase III, chi subunit  32.12 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.706687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3528  DNA polymerase III, chi subunit  36.56 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0021621  normal  0.458218 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2788  DNA polymerase III chi subunit HolC  35.21 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1270  DNA polymerase III, chi subunit  39.36 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0791  DNA polymerase III, chi subunit  29.5 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0917  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.97 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.741831  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2866  DNA polymerase III chi subunit, HolC  26.96 
 
 		 153 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0418858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1009  DNA polymerase III chi subunit, HolC  27.93 
 
 		 156 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11640  DNA polymerase III subunit chi  34.23 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2806  DNA polymerase III subunit chi  31.31 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.654553  normal  0.315604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>