More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0521 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  100 
 
 
332 aa  667    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  98.41 
 
 
315 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  87.05 
 
 
376 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5578  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.11 
 
 
328 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.15 
 
 
337 aa  401  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  59.38 
 
 
330 aa  397  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.09 
 
 
323 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.29 
 
 
319 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  53.97 
 
 
319 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.33 
 
 
319 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3218  alcohol dehydrogenase  49.4 
 
 
332 aa  266  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5595  zinc-binding oxidoreductase  42.94 
 
 
347 aa  248  8e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.56 
 
 
316 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  32.81 
 
 
318 aa  152  7e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  59.09 
 
 
200 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  26.12 
 
 
358 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
373 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.45 
 
 
373 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
373 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.45 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10900  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  31.04 
 
 
352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.867442  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  28.91 
 
 
373 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.71 
 
 
348 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.9 
 
 
366 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.83 
 
 
344 aa  105  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
329 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 
327 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  26.89 
 
 
345 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
345 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  37.27 
 
 
322 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.4 
 
 
346 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0299  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.52 
 
 
336 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3142  alcohol dehydrogenase  30.03 
 
 
373 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.4 
 
 
378 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  32.1 
 
 
327 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1530  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.02 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0540116  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.89 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2220  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.16 
 
 
343 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.135715 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
337 aa  96.3  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.43 
 
 
378 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.43 
 
 
378 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.39 
 
 
354 aa  95.9  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.1 
 
 
336 aa  95.9  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.9 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.43 
 
 
378 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.43 
 
 
378 aa  95.9  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.18 
 
 
350 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.29 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3324  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.24 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000796968  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.12 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  24.58 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.11 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  27 
 
 
375 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  33.46 
 
 
344 aa  95.1  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  25.65 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  30.99 
 
 
327 aa  94.7  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.02 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  30.71 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3188  alcohol dehydrogenase  27.06 
 
 
366 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4846  alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.475925  normal  0.0130408 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.37 
 
 
336 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
347 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  26.93 
 
 
336 aa  93.2  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.63 
 
 
346 aa  93.2  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  26.85 
 
 
378 aa  92.8  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  29.29 
 
 
346 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.18 
 
 
320 aa  92.8  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07420  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  27.52 
 
 
357 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.82 
 
 
381 aa  92.4  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2330  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.83 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.752502  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1356  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  26.2 
 
 
366 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  29.48 
 
 
337 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.06 
 
 
357 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.07 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0511  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.78 
 
 
337 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.203373  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.12 
 
 
341 aa  92  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4187  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.11 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7070  alcohol dehydrogenase  28.11 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0981  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.76 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3643  alcohol dehydrogenase  31.1 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.826426  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.01 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0252  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.75 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0180  alcohol dehydrogenase  32.2 
 
 
325 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.93 
 
 
371 aa  89.4  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.27 
 
 
329 aa  89.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.91 
 
 
339 aa  89.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  25.93 
 
 
371 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.93 
 
 
371 aa  89.4  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.4 
 
 
362 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.92 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  22.22 
 
 
352 aa  89  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 
344 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3065  alcohol dehydrogenase  33.09 
 
 
338 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.456044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3346  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.48 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  35.75 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>