More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5578 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5578  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
328 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  71.04 
 
 
330 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  62.77 
 
 
337 aa  436  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  65.19 
 
 
376 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  64.24 
 
 
315 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  62.11 
 
 
332 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.47 
 
 
323 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.06 
 
 
319 aa  321  8e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.06 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  52.06 
 
 
319 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5595  zinc-binding oxidoreductase  52.42 
 
 
347 aa  306  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3218  alcohol dehydrogenase  48.57 
 
 
332 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.7 
 
 
316 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  32.41 
 
 
318 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.74 
 
 
200 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  24.23 
 
 
358 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5447  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.03 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187392  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.37 
 
 
385 aa  94  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.48 
 
 
341 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0589  alcohol dehydrogenase  30.3 
 
 
350 aa  91.7  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00429801  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0705  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.92 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4631  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.92 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000566989  hitchhiker  0.000000000000161972 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0585  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  29.92 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0307293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0584  zinc-containing alcohol dehydrogenase, long-chain  29.92 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0802  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.92 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  30.65 
 
 
336 aa  90.9  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  27.99 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.51 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.02 
 
 
325 aa  89.7  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1037  putative dehydrogenase  23.65 
 
 
340 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
362 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0021  Zn-binding dehydrogenase  24.13 
 
 
352 aa  89.7  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0554419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
348 aa  89.7  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0803  putative dehydrogenase  23.93 
 
 
343 aa  89.7  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.506069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2647  dehydrogenase  25.93 
 
 
338 aa  89.4  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0114296  normal  0.147618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0742  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.01 
 
 
350 aa  89  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000731787  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0641  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.55 
 
 
350 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0675  alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
350 aa  89  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000371622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0730  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.55 
 
 
350 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.35905e-47 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5268  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27 
 
 
346 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.78 
 
 
366 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2272  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  26.72 
 
 
374 aa  87.8  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  28.99 
 
 
362 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.99 
 
 
326 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.23 
 
 
373 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
336 aa  87  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.77 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4724  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.86 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.383474  normal  0.446449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  25.28 
 
 
375 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02400  theronine dehydrogenase-like Zn-dependent dehydrogenase  29.55 
 
 
345 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.242832  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  30.5 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  28.99 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3460  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.04 
 
 
354 aa  86.3  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00073426  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.78 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  27.78 
 
 
362 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.9 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.7 
 
 
335 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1628  zinc-type alcohol dehydrogenase  23.77 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  32.31 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.31 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  23.98 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.94 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  28.94 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.86 
 
 
378 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  25.07 
 
 
371 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  32.31 
 
 
341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0934  2,3-butanediol dehydrogenase  27.49 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.07 
 
 
371 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0732  L-iditol 2-dehydrogenase  23.1 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  27.84 
 
 
354 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10230  2,3-butanediol dehydrogenase  27.03 
 
 
363 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.219159  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  25.07 
 
 
371 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.69 
 
 
328 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.88 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2061  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  26.76 
 
 
339 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  26.45 
 
 
337 aa  84  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  30.49 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2411  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  25.89 
 
 
373 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.06 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2551  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.07 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.36 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.88 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.88 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  31.88 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2145  Alcohol dehydrogenase GroES domain-containing protein  28.44 
 
 
346 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552645  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.88 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  27.68 
 
 
347 aa  83.2  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1713  zinc-type alcohol dehydrogenase  23.48 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1494  alcohol dehydrogenase  32.19 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.275992  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1477  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.268909  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25.14 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 
344 aa  82.8  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>