More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2536 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_2536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  100 
 
 
323 aa  649    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165243 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5578  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  58.47 
 
 
328 aa  381  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  55.03 
 
 
330 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.53 
 
 
337 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  55.24 
 
 
315 aa  341  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  54.09 
 
 
332 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.86 
 
 
319 aa  329  3e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  54.55 
 
 
319 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  51.43 
 
 
376 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  53.29 
 
 
319 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3218  alcohol dehydrogenase  54.26 
 
 
332 aa  298  8e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  97.41 
 
 
200 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5595  zinc-binding oxidoreductase  37.91 
 
 
347 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.78 
 
 
316 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  31.35 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0359  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.59 
 
 
366 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3786  alcohol dehydrogenase  31.23 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0107971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22030  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  28.16 
 
 
375 aa  116  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255526  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5466  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.0829425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3550  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.37 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4817  alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
362 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.562057  normal  0.226619 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4198  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4721  alcohol dehydrogenase  30.66 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.36355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0887  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  30.66 
 
 
362 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214815  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4579  alcohol dehydrogenase  30.14 
 
 
373 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0951  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.28 
 
 
371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.286052  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3288  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.28 
 
 
371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3421  alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 
371 aa  111  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2740  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.17 
 
 
344 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2089  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.45 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2432  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  31.44 
 
 
363 aa  108  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319398  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0041  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.97 
 
 
341 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000412094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.52 
 
 
356 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2599  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
362 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.139182  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2554  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.56 
 
 
362 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2593  alcohol dehydrogenase  31.56 
 
 
362 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0149814  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2055  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.86 
 
 
363 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  30.19 
 
 
326 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0503  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
362 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472686 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3155  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.57 
 
 
342 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3233  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.74 
 
 
365 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0470623  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  26.82 
 
 
358 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.73 
 
 
337 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.08 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1810  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.08 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0844  threonine dehydrogenase  31.2 
 
 
347 aa  99.8  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1099  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.08 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.488512  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0808  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.08 
 
 
378 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0860  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.49 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183529  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1911  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.49 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.197112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1924  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.49 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1195  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.49 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.184304  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1639  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.49 
 
 
363 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.514454  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4132  alcohol dehydrogenase  32.73 
 
 
364 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00103108  normal  0.177919 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3845  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.16 
 
 
354 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.650761  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0301  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.49 
 
 
430 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487501  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4523  alcohol dehydrogenase  32.29 
 
 
365 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11719  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2567  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  28.18 
 
 
371 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.134706  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2072  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  29.49 
 
 
422 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.055624  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  29.75 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0547  alcohol dehydrogenase  26.74 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.986986 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0364  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.79 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5781  alcohol dehydrogenase  31.8 
 
 
354 aa  97.1  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110473  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23320  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  34.18 
 
 
322 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.115564  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1325  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  32.39 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.614702  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2224  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.41 
 
 
381 aa  96.3  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.53 
 
 
346 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0459  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.51 
 
 
378 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.479531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  29.14 
 
 
325 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4416  alcohol dehydrogenase  32.04 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164512  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0597  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
362 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0924  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.64 
 
 
326 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.284125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  28.83 
 
 
325 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  29.11 
 
 
325 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1610  alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 
408 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3953  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
354 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1506  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  27.25 
 
 
408 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000397792  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1170  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.58 
 
 
349 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  27.35 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.174722  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  32.36 
 
 
326 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0449  alcohol dehydrogenase  29.74 
 
 
324 aa  93.6  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0495582  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.27 
 
 
326 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1795  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.22 
 
 
378 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1762  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family protein  27.25 
 
 
355 aa  93.2  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0108342  hitchhiker  0.000113364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  29.72 
 
 
325 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase  25.29 
 
 
345 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0591  alcohol dehydrogenase  31.21 
 
 
362 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25.89 
 
 
335 aa  92.8  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.72 
 
 
325 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  28.12 
 
 
325 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0552  2,3-butanediol dehydrogenase  31.21 
 
 
362 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 
347 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
325 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1166  alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 
351 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.343531  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3224  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.33 
 
 
357 aa  91.7  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0388  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.86 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00875101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0270  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.55 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  28.24 
 
 
341 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
329 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  29.94 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>