More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5595 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011988  Avi_5595  zinc-binding oxidoreductase  100 
 
 
347 aa  700    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5578  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.42 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3886  alcohol dehydrogenase  49.55 
 
 
330 aa  285  9e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.025285  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2784  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.62 
 
 
337 aa  266  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2173  alcohol dehydrogenase  43.33 
 
 
315 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0299508  decreased coverage  0.00992206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0521  putative Zn-containing dehydrogenase  42.94 
 
 
332 aa  248  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2432  alcohol dehydrogenase  42.77 
 
 
376 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  37.91 
 
 
323 aa  219  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1190  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  41.09 
 
 
319 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.842933  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1121  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  40.79 
 
 
319 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00941244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1062  zinc-binding alcohol dehydrogenase  39.76 
 
 
319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0715122  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3218  alcohol dehydrogenase  34.24 
 
 
332 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.43 
 
 
316 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1677  alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.966295 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5179  alcohol dehydrogenase  29.24 
 
 
348 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.86 
 
 
336 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0464  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.47 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.34246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2970  Beta-ketoacyl synthase  32.08 
 
 
1841 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966236 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0419  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  31.1 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0538396  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1743  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  23.98 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.789152  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2003  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  30.43 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.05102  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2268  alcohol dehydrogenase  22.4 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.396502  hitchhiker  0.0088894 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2575  alcohol dehydrogenase  30.51 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0270  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  31.06 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.974154  normal  0.251208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3470  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.88 
 
 
337 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5304  alcohol dehydrogenase  25.55 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.183348  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.75 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.71 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1685  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.5 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.69 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.165067  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1508  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.2 
 
 
325 aa  67  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3409  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.84 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149484  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5133  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.95 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.4 
 
 
323 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5726  alcohol dehydrogenase  26.95 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3217  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.94 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  23.01 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.01 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  23.01 
 
 
347 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0782  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.27 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.793313  normal  0.107326 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5001  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  23.01 
 
 
347 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2398  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.73 
 
 
335 aa  64.7  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.860037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2447  alcohol dehydrogenase  32.31 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.767036  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4548  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.55 
 
 
355 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00643704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0337  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  28.96 
 
 
338 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0615  putative oxidoreductase  34.21 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4415  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.55 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  22.74 
 
 
347 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1245  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  26.67 
 
 
338 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.490679  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1036  alcohol dehydrogenase  31.13 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  22.74 
 
 
347 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  23.72 
 
 
354 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.31 
 
 
337 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4497  alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
373 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2724  alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
324 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0988305  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3148  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  25.09 
 
 
373 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12757  alcohol dehydrogenase  24.79 
 
 
340 aa  63.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2445  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  22.01 
 
 
347 aa  62.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.682207  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2435  alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.953157  normal  0.115745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
342 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6496  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  38.14 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  22.47 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0281  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.38 
 
 
320 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3146  alcohol dehydrogenase  27.16 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0679914  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0942  zinc-binding alcohol dehydrogenase  27.89 
 
 
324 aa  61.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0332655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.03 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3343  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  27.16 
 
 
337 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.441292  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3317  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  29.02 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3514  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  24.44 
 
 
345 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3723  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5659  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.591767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0488  alcohol dehydrogenase  29.53 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0679  alcohol dehydrogenase  26.63 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4645  alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3336  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.86 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0716  NADPH/quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
328 aa  60.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.655261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  26.61 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.23 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  27.75 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  21.37 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03640  putative NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  27.35 
 
 
353 aa  60.1  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  29.65 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.05 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1166  alcohol dehydrogenase  30.62 
 
 
333 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  27.67 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4637  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.98 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3686  alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
331 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.343623  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3890  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.89 
 
 
337 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2465  alcohol dehydrogenase  31.65 
 
 
324 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2371  alcohol dehydrogenase  27.9 
 
 
328 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603906  normal  0.87569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.09 
 
 
340 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0894  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  28.51 
 
 
332 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.82 
 
 
346 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5428  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.57 
 
 
330 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2213  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.02 
 
 
310 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.16 
 
 
351 aa  59.3  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>